Dear Users:<br><br>I used all-bonds for constraints. My MD is dead right after i submit the task. The error message is :<br><br>Step 0, time 0 (ps)  LINCS WARNING<br>relative constraint deviation after LINCS:<br>max 2.084475 (between atoms 23417 and 23431) rms 0.054595<br>

bonds that rotated more than 30 degrees:<br><br>Anyone knows what is the problem and how i can fix it?<br>Thanks<br> <br><br>-- <br>Yanmei Song<br>Ph.D. Candidate<br>Department of Chemical Engineering<br>Arizona State University<br>