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<head>
<style><!--
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Verdana
}
--></style>
</head>
<body class='hmmessage'>
<BR>&nbsp;Hi,<BR>
I would like to calculate the PMF of an ion along a channel using Gromacs 4, and I have a doubt about the&nbsp;options I should use in the .mdp file:<BR>
&nbsp;<BR>
-which option should I choose for pull_geometry: distance? direction? or position?<BR>
-which is the equivalent option to the old "Pos1" (in Gromacs 3)&nbsp;for the Gromacs 4 version?<BR>
&nbsp;<BR>
Thank you very much for your help.<BR>
Best wishes,<BR>
&nbsp;<BR>
Rebeca Garcia Fandiño<BR>
Oxford Universtity<BR>
UK<BR>                                               <br /><hr />49 habitantes, 49 expertos en Windows 7. Así es Sietes, <a href='http://www.sietesunpueblodeexpertos.com/' target='_new'> ¡Visítalo!</a></body>
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