<div>Hi</div>
<div> </div>
<div>I did command (mdrun -s -o -c -e -g) but following error was came up where as my dt is 0.001 ps in mdp file:</div>
<div> </div>
<div>t = 0.005 ps: Water molecule starting at atom 20937 can not be settled.<br>Check for bad contacts and/or reduce the timestep.<br>Wrote pdb files with previous and current coordinates.</div>
<div> </div>
<div>I reduced time step but same error was came up again.I enlarged box size but same error was came up again.</div>
<div> </div>
<div>please guide me.<br></div>