Hello all,<br><br>   I have tried this command line to find the density of a system at particular time interval: <br><br>g_density -f traj.xtc -s topol.tpr -b 1228 -e 1328 -o density.xvg, <br><br>but I keep having the result to the full mdrun. The plot of the density vs box dimension is also obtained via xmgrace. I need to plot this density in terms of time. Is it possible to do so? Also, I need help with help with adjusting the above command line so that I can find the density of only one segment of the run.<br>
<br>Thanks,<br>Lum<br>