<div>dear justin</div>
<div> </div>
<div>I transfer gro files from linux to windows through SSH secure shell program. I added 10 Na ions by genion command but in gro file following case is appeared:</div>
<div> </div>
<div>7208Na      Na23127   1.533   2.176   2.687  0.1841 -0.1829 -0.2991<br> 7209Na      Na23128   0.179   2.821   0.336 -0.2683 -0.1820  0.5803<br> 7210Na      Na23129   2.288   0.458   4.819 -0.1171  0.7612 -0.4903<br>
 7211Na      Na23130   3.640   1.815   1.138 -0.1083 -0.1591  0.0485<br> 7212Na      Na23131   2.183   3.845   1.964 -0.0409 -0.1492  0.6725<br> 7213Na      Na23132   3.356   5.216   5.834 -0.2686  0.1059 -0.1660<br> 7214Na      Na23133   4.304   2.510   0.809 -0.2994  0.3939  0.7264<br>
 7215Na      Na23134   4.609   4.931   0.535 -0.2609  0.1315 -0.1767<br> 7216Na      Na23135   5.553   6.022   5.152  0.3516 -0.2021  0.2022<br> 7217Na      Na23136   5.865   1.114   5.034  0.0442  0.0272  0.3437</div>
<div><strong>7218Cl        Cl23137    0.000   0.000   0.000  0.0000   0.0000 0.0000 <br></strong>   6.15463   6.21503   6.20117</div>
<div> </div>
<div>I deleted line of        7218Cl        Cl23137    0.000   0.000   0.000  0.0000   0.0000 0.0000 </div>
<div> </div>
<div>in top file following case is appeared: <br></div>
<div>[ molecules ]<br>; Compound        #mols<br>Protein_A           1<br>Protein_B           1<br>SOL         7117<br>Na          10<br>Cl          0</div>
<div> </div>
<div>I deleted last line.</div>
<div> </div>
<div>I am using amber03 force field in gromacs program to study interaction of pr-dna.</div>