Hi everyone,<div><br></div><div>I am trying to analyze dihedrals of molecules after a simulation. I am able to calculate dihedral distribution at ant particular time using g</div><div>-angle and proper group using</div><div>
<br></div><div>g_angle -f after_md.trr -b 800 -type dihedral -n chain1.ndx -od dihed12</div><div><br></div><div>This gives me the distribution at t=800 ps . What i really want is to see the dihedral distribution at all time steps (after 800 ps) in one go, and may be do some averaging later. Is there a straight forward way to do this. I can imagine that i could write a script file that could do this but then i dont want to deal with a lot of files, i rather want everything to be saved in a single file with multiple columns. Could someone suggest a trick for this?</div>
<div><br></div><div>Thank you,</div><div>Amit</div>