<br>            hai justin, <br><blockquote><jalemkul@vt.edu><br>ya its robust. and urs is the only tutorial which i found for transmembrane protein MD simulation in GROMACS. Its really useful. thank you.<br><br>As you said i tried it in other system also there i used gromacs version 3.3.3. i am getting the same kind of error.<br>I didnt use any special configuration flags for installation, for both the versions and in both the <br>systems.<br><br>And the compiler which i am using is  <span style="font-weight: bold;">gcc version 4.1.2 20070626 (Red Hat 4.1.2-14)<br><br><span style="font-weight: bold;">T</span></span>hanks in advance<br><br>with regards <br>N.Hema Dhevi</jalemkul@vt.edu></blockquote>