Hi Leila,<br><br>Try the -od option in g_rmsf.<br><br>Regards,<br>Joćo<br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Dec 9, 2009 at 8:56 AM, leila karami <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:karami.leila1@gmail.com">karami.leila1@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><font size="2">
<p>Hi</p>
<p>g_rms gives us a xvg file containing rmsd vs time.</p>
<p>I want obtain rmsd vs residue number.</p>
<p>what option should be used with g_rms?</p>
<p>Any help will highly appreciated!</p></font>
<br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Joćo M. Damas<br>PhD Student<br>

Protein Modelling Group<br>ITQB-UNL, Oeiras, Portugal<br>Tel:+351-214469613<br>