<html>
<head>
<style><!--
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Verdana
}
--></style>
</head>
<body class='hmmessage'>
It is easy to make one yourself. I would use molden to draw&nbsp; ammonia and save as pdb file.&nbsp; You might need to minimize before using for md.<br><br>Abu<br><br><div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>&nbsp;</div></div></div></div></div></div></div><br><br><br><br>&gt; Date: Thu, 31 Dec 2009 16:21:29 -0500<br>&gt; From: nishap.patel@utoronto.ca<br>&gt; To: gmx-users@gromacs.org<br>&gt; Subject: [gmx-users] pdb file for ammonia<br>&gt; <br>&gt; Does anyone know where I can get a pdb file for ammonia? I tried  <br>&gt; searching but I am not sure if there is a website for the pdb files I  <br>&gt; can use in gromac. Any suggestions would be helpful.<br>&gt; <br>&gt; Thanks.<br>&gt; <br>&gt; Nisha<br>&gt; <br>&gt; -- <br>&gt; gmx-users mailing list    gmx-users@gromacs.org<br>&gt; http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<br>&gt; Please search the archive at http://www.gromacs.org/search before posting!<br>&gt; Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>&gt; www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<br>&gt; Can't post? Read http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php<br>                                               <br /><hr />Have more than one Hotmail account? <a href=' http://clk.atdmt.com/UKM/go/186394591/direct/01/' target='_new'>Link them together to easily access both.</a></body>
</html>