Do you have a DSSP program on your system? If no, please install executable DSSP program from <a href="http://swift.cmbi.kun.nl/gv/dssp/">http://swift.cmbi.kun.nl/gv/dssp/</a> website.<br><br>Rasoul<br><br><div class="gmail_quote">
On Wed, Jan 6, 2010 at 11:34 AM, leila karami <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:karami.leila1@gmail.com">karami.leila1@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<div>Hi</div>
<div> </div>
<div>I apply following command:</div>
<div> </div>
<div>do_dssp -f rrr.xtc -s tttt.tpr -n n.ndx -map ss.map </div>
<div> </div>
<div>but following error is came up:</div>
<div> </div>
<div>Fatal error:<br>Failed to execute command: /usr/local/bin/dssp -na ddal9qL4 ddRvmyo0 &gt; /dev/null 2&gt; /dev/null</div>
<div> </div>
<div><font size="2">
<p>Any help will highly appreciated!</p></font><br></div>
<br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br></blockquote></div><br>