Dear all,<br>
I am using MD simulation of a protein on Silicon nitride surface. The
surface has been created using VMD and tcl script (ref. bionano
tutorial).The protein+surface complex also has been generated using
VMD.Using that PDB file I have done md simulation in gromacs. One itp
file for silicon nitride has been developed using PRODRG server and
included in the top file. <br>
But, during energy minimisation  I got a message <br>
Steepest Descents did not converge to Fmax &lt; 8000 in 2001 steps.<br>
Potential Energy  = -4.5347610e+06<br>
Maximum force     =  1.0913173e+05 on atom 7417<br>
Norm of force     =  2.8918979e+02<br>
<br>
The EM ends without converging to Fmax. I put different  values of
Fmax and steps starts from 1000. But for  Fmax 8000 and  2000
steps also I am getting the same message. What force field I can use
for Silicon nitride surface? How can I rectify this error? <br>
- T.Kothai<br>
Centre for Biotechnology<br>
Anna University Chennai<br>
<br>