<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-2">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.7654.12">
<TITLE>Dihedral time of circulation</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<!-- Converted from text/rtf format -->
<BR>

<P><FONT SIZE=2 FACE="Arial">Dear GROMACS users,</FONT>
</P>

<P><FONT SIZE=2 FACE="Arial">I have a question about dihedral time of circulation: what is the typical time for a rotation of 360 deg of an unconstrained dihedral in the side chain of an amino acid at 300K ? For example dihedral rotation of MET side chain in a ALA-MET-ALA side chain. A use OPLSAA/tip4p FF.</FONT></P>

<P><FONT SIZE=2 FACE="Arial">Many thanks</FONT>

<BR><FONT SIZE=2 FACE="Arial">Sa</FONT><FONT SIZE=2 FACE="Arial CE">ša</FONT>
</P>
<BR>

<P><FONT SIZE=2 FACE="Arial CE">-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+</FONT>
</P>

<P><FONT SIZE=2 FACE="Arial CE">Saša Bjelic, PhD</FONT>

<BR><FONT SIZE=2 FACE="Arial CE">Structural Biology and Biophysics</FONT>

<BR><FONT SIZE=2 FACE="Arial CE">Life Science, OFLC 105</FONT>

<BR><FONT SIZE=2 FACE="Arial CE">Paul-Scherrer-Institute</FONT>

<BR><FONT SIZE=2 FACE="Arial CE">CH-5232 Villigen PSI</FONT>

<BR><FONT SIZE=2 FACE="Arial CE">Switzerland</FONT>
</P>

<P><FONT SIZE=2 FACE="Arial CE">Phone:&nbsp; +41-(0)56 310 5295</FONT>

<BR><FONT SIZE=2 FACE="Arial CE">Fax:&nbsp;&nbsp;&nbsp; +41 56 310 5288</FONT>
</P>

<P><FONT SIZE=2 FACE="Arial CE">-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+</FONT>
</P>

</BODY>
</HTML>