Hi all,<br><br>i used united the atom force field model for the membrane lipids . to calculate order parameter i used :<br>g_order  -od   -d <br>  <br> i know united atom force field doesn&#39;t  have hydrogen atoms in hydrocarbons chains .<br>
 i want to know gromacs calculates order parameter <b> Sc-c</b> or <b>Sc-d</b> (Deuterium) ? <br><br clear="all"> in the output is written:  title &quot;Deuterium order parameters&quot;<br><br>thanks in advance,<br>Afsaneh <br>