<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
Dear all<br>
<br>
I would like to do some simulation with the TIP4p water model with the
ffG53a6 (Gromos96) force field.<br>
<br>
In <b>TIP4p.itp</b> it states to use the <b>OWT4</b> atom for the
oxygen and the <b>IW</b> for the charged atom (4 site water model),
but these two atoms are not listed in the <b>ffG53a6nb.itp</b> and <b>ffG53a6bon.itp</b>
files. This means that GROMACS can not find these atoms and how to
calculate LJ and bonded forces with these atoms...<br>
<br>
Have I overseen something or are they suddenly lost from the gromos
itp's in GROMACS??<br>
<br>
The OW atom in the itp's are for the SPC/E water model - so they are
not use able for TIP4p (different LJ parameters)<br>
<br>
<br>
Best regard!<br>
Rasmus<br>
<br>
<div class="moz-signature">-- <br>
PhD student at "Center for Energy Resources Engineering" (CERE-DTU)<br>
Department of Chemical and Biochemical Engineering, Building 229<br>
Technical University of Denmark - DTU<br>
DK - 2800 Lyngby, Denmark<br>
Email: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:RAL@kt.dtu.dk">RAL@kt.dtu.dk</a>
</div>
</body>
</html>