<html>
<head>
<style><!--
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Verdana
}
--></style>
</head>
<body class='hmmessage'>
<br>Hi,<br>I would like to calculate the density maps for the water inside a pore that has a cilindrical shape, but not the water outside it, that is also present in the box.<br>I don´t understand vey well the options of g_densmap "-amax" and "-rmax". With -amax I define the maximun axial distance from the center, let´s say the principal axis of my pore. With -rmax, I define the maximun radial distance, but is this in a perpendicular direction to the axis? or also in 3 directions? Because, if it is in 3 directions, and my pore is cilindrical (not spherical), so rmax &gt;&gt; amax, there will be a region that is not going to be taking into account for the density calculation...<br>Could anybody explain a little more about rmax and amax options of g_densmap, please?<br>Thank you very much in advance.<br>Best wishes,<br><br>Rebeca Garcia.<br>                                               <br /><hr />Disfruta de un resumen diario de tu Hotmail en tu móvil Movistar. <a href='http://serviciosmoviles.es.msn.com/hotmail/movistar.aspx' target='_new'>¡Accede ya!</a></body>
</html>