Hi Everyone,<div><br></div><div>I am trying to run a simulation with the option &quot;pbc=xy&quot; turned on. I am using 64 processors for the simulation. The mdrun_mpi evokes the following error message before starting the md steps</div>
<div><br></div><div><div>There is no domain decomposition for 64 nodes that is compatible with the given box and a minimum cell size of 0.889862 nm</div><div>Change the number of nodes or mdrun option -rdd or -dds</div><div>
Look in the log file for details on the domain decomposition</div><div><br></div><div>This has to do with the load balancing in the domain decomposition version of mdrun. Can anyone suggest me how to set the option -rdd or -dds?</div>
<div><br></div><div>Also the simulation runs fine on one node (with domain decomposition) and with particle decomposition but both of them extremely slow.</div><div><br></div><div><br></div><div>Thank you,</div><div>Amit</div>
</div>