I m trying to reproduce the same thing, by following the tutorial.<br>i m trying to learn the coarse grain simulation with their files, so that i can apply for my protein.<br>Starting with lipids, as per their tutorial<br>

I m just doing the steps in that tutorial, with their files,<br>after the genbox,<pre>genbox -ci dspc_single.gro -nmol 128 -box 7 7 7 -try 100 -o 128_noW.gro</pre> grompp <br><pre>grompp -f em.mdp -c 128_noW.gro -p dspc.top -maxwarn 10<br>

</pre><br>shows the error, number atoms doesnt match,as<br><br>Fatal error:<br>number of coordinates in coordinate file (128_noW.gro, 1400)<br>             does not match topology (dspc.top, 1792)<br><br>