<font color='black' size='2' face='arial'><br>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT face="Times New Roman" size=3>Hi</FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><?xml:namespace prefix = o ns = "urn:schemas-microsoft-com:office:office" /><o:p><FONT face="Times New Roman" size=3>&nbsp;</FONT></o:p></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT face="Times New Roman" size=3>I used g_hbond for analyzing hydrogen bonds.</FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><o:p><FONT face="Times New Roman" size=3>&nbsp;</FONT></o:p></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT face="Times New Roman" size=3>What is difference between [s0 legend "Ac\sfin sys\v{}\z{}(t)"] and [s1 legend "Ac(t)"] in hbac.xvg file in below?</FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><o:p><FONT face="Times New Roman" size=3>&nbsp;</FONT></o:p></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman">@<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>title "Hydrogen Bond Autocorrelation"<o:p></o:p></FONT></FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman">@<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>xaxis<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp; </SPAN>label "Time (ps)"<o:p></o:p></FONT></FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman">@<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>yaxis<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp; </SPAN>label "C(t)"<o:p></o:p></FONT></FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><o:p><FONT face="Times New Roman" size=3>&nbsp;</FONT></o:p></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman">@ s0 legend "Ac\sfin sys\v{}\z{}(t)"<o:p></o:p></FONT></FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman">@ s1 legend "Ac(t)"<o:p></o:p></FONT></FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><SPAN lang=NL style="mso-ansi-language: NL"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman">@ s2 legend "Cc\scontact,hb\v{}\z{}(t)"<o:p></o:p></FONT></FONT></SPAN></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><SPAN lang=NL style="mso-ansi-language: NL"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman">@ s3 legend "-dAc\sfs\v{}\z{}/dt"<o:p></o:p></FONT></FONT></SPAN></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman"><SPAN lang=NL style="mso-ansi-language: NL"><SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN></SPAN>0<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>1<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>1<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp; </SPAN>-0.00217462<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.275102<o:p></o:p></FONT></FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman"><SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>2<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.4543<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.847763<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.0871663<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.144609<o:p></o:p></FONT></FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman"><SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>4<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.421563<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.83863<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.0883458<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.0141166<o:p></o:p></FONT></FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman"><SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>6<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.397833<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.83201<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.0893797<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.0101501<o:p></o:p></FONT></FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman"><SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>8<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.380963<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.827303<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.0896131<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp; </SPAN>0.00766257<o:p></o:p></FONT></FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman"><SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>10<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.367183<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.823459<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.0899727<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp; </SPAN>0.00601236<o:p></o:p></FONT></FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman"><SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>12<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.356914<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.820594<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.0902401<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp; </SPAN>0.00526451<o:p></o:p></FONT></FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT size=3><FONT face="Times New Roman"><SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>14<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.346125<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.817584<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.0900176<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;&nbsp; </SPAN>0.004734</FONT></FONT></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><o:p><FONT face="Times New Roman" size=3>&nbsp;</FONT></o:p></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><FONT face="Times New Roman" size=3>Are both of them </FONT><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; COLOR: black; FONT-FAMILY: Arial">Are&nbsp;both of them Autocorrelation function?</SPAN></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><o:p><FONT face="Times New Roman" size=3>&nbsp;</FONT></o:p></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><o:p><FONT face="Times New Roman" size=3>&nbsp;</FONT></o:p></div>


<div class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><o:p><FONT face="Times New Roman" size=3>&nbsp;</FONT></o:p></div>
<br>


<div style="CLEAR: both"></div>
</font>