Dear all,<br><br>I am sorry for poorly describing my problem about the freezing group size. Here I am giving my question very briefly, can anybody help me please?<br><br>I would like to know the relation between the size of freezing group and the temperature coupling. when I separate the temperature coupling for freezing and non freezing groups the initial temperature for whole system is showing me zero in the log file, and the non-freezing group is just vibrating not at all moving during the course of simulation. This is true only when I am using large freezing group (freezing group has 26540 atoms and non-freezing group has around 9000 atoms). However if I use small freezing group (freezing group has 7340 atoms and non-freezing group has around 25840 atoms) I am getting log file with initial temperature as 300K, and the non-freezing group is moving well and the diffusion coefficient of solvent is matching with its corresponding value in the bulk (with out freezing). <br>
<br>I hope somebody understand my problem now!!! thanks very much.<br><br>Thanks in advance<br>Srinivas.<br clear="all"><br>-- <br>*********************************************<br>J. Srinivasa Rao<br>Post-doctoral Research Associate<br>
Computational Biophysics Group<br>Department of Physics<br>Drexel University<br>3141 Chestnut St<br>Philadelphia, PA 19104<br>Ph:  Off:     215-895-1989<br>        Mob:  704-706-4191<br>Web:<a href="http://jsrao.web.officelive.com/default.aspx">http://jsrao.web.officelive.com/default.aspx</a><br>
**********************************************<br><br><br>