<div style="font-family: 'Times New Roman'; font-size: 16px;">Dear GROMACS users,<br _moz_dirty="" />I wanted to do a test calculation on a linear unrealistic molecule PPPBC without any contributions to energy exept of LJ nonbenoded interactions. I have prepared a topol.top file which I am sending. After processing this file with grompp I obtained a message<br _moz_dirty="" /><br _moz_dirty="" />WARNING 1 [file topol.top, line 63]:<br _moz_dirty="" />  Too few parameters on line (source file confio.c, line 776)<br _moz_dirty="" /><br _moz_dirty="" />Line 63 is the last line of topol.top. I followed the manual and I am not able to fix the problem. Please could you have a look at this file and possibly to find out what is missing. Thank you in advance<br _moz_dirty="" />Zuzana<br _moz_dirty="" /><br _moz_dirty="" />[ defaults ]<br _moz_dirty="" />; nbfunc        comb-rule       gen-pairs       fudgeLJ fudgeQQ<br _moz_dirty="" />  1             2               yes             1.0     1.0<br _moz_dirty="" /><br _moz_dirty="" />[ atomtypes ]<br _moz_dirty="" />;at. type at.num     mass      charge    ptype     sigma           epsilon<br _moz_dirty="" />P           1         1          0.         A         1               1<br _moz_dirty="" />B           1         1          0.         A         2               2<br _moz_dirty="" />C           1         1          0.         A         3               1.5<br _moz_dirty="" /><br _moz_dirty="" />[ bondtypes ]<br _moz_dirty="" />; i    j func        b0          kb<br _moz_dirty="" />P      P    1         1          0.<br _moz_dirty="" />P      B    1         1          0.<br _moz_dirty="" />B      C    1         1          0.<br _moz_dirty="" /><br _moz_dirty="" />[ angletypes ]<br _moz_dirty="" />;  i    j    k  func       th0       cth<br _moz_dirty="" />P       P    P   1         0         0.<br _moz_dirty="" />P       B    C   1         0         0.<br _moz_dirty="" />P       P    B   1         0         0.<br _moz_dirty="" /><br _moz_dirty="" />[ dihedraltypes ]<br _moz_dirty="" />P   P   P   B     1     0    0    1<br _moz_dirty="" />P   P   B   C     1     0    0    1<br _moz_dirty="" /><br _moz_dirty="" />[ moleculetype ]<br _moz_dirty="" />; Name            nrexcl<br _moz_dirty="" />Protein             3<br _moz_dirty="" /><br _moz_dirty="" />[ atoms ]<br _moz_dirty="" />;   nr       type  resnr residue  atom   cgnr     charge       mass<br _moz_dirty="" />1           P       1      R        P     1         0           1<br _moz_dirty="" />2           P       1      R        P     1         0           1<br _moz_dirty="" />3           P       1      R        P     1         0           1<br _moz_dirty="" />4           B       1      R        B     1         0           1<br _moz_dirty="" />5           C       1      R        C     1         0           1<br _moz_dirty="" /><br _moz_dirty="" />[ bonds ]<br _moz_dirty="" />;  ai    aj funct            c0            c1            c2            c3<br _moz_dirty="" />1    2      1<br _moz_dirty="" />2    3      1<br _moz_dirty="" />3    4      1<br _moz_dirty="" />4    5      1<br _moz_dirty="" /><br _moz_dirty="" />[ angles ]<br _moz_dirty="" />;  ai    aj    ak funct            c0            c1            c2            c3<br _moz_dirty="" />1      2    3      1<br _moz_dirty="" />2      3    4      1<br _moz_dirty="" />3      4    5      1<br _moz_dirty="" /><br _moz_dirty="" />[ dihedrals ]<br _moz_dirty="" />;  ai    aj    ak    al funct<br _moz_dirty="" />1    2   3    4   1<br _moz_dirty="" />2    3   4    5   1<br _moz_dirty="" /><br _moz_dirty="" />[ system ]<br _moz_dirty="" />; Name<br _moz_dirty="" />Protein<br _moz_dirty="" /><br _moz_dirty="" />[ molecules ]<br _moz_dirty="" />; Compound        #mols<br _moz_dirty="" />Protein            1<br _moz_dirty="" /><br _moz_dirty="" /><br /></div>