Actually, I tried 4.0.7 first from this link,<br><a href="http://www.gromacs.org/index.php?title=Download_%26_Installation">http://www.gromacs.org/index.php?title=Download_%26_Installation</a><br><br>It didn&#39;t work (same error). That&#39;s why I downloaded 4.0.6 from the same webpage.<br>
<br><div class="gmail_quote">On Fri, Mar 5, 2010 at 10:51 AM, Justin A. Lemkul <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:jalemkul@vt.edu">jalemkul@vt.edu</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<div><div></div><div class="h5"><br>
<br>
Dian Jiao wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
I was following the instruction to install gromacs 4.0.6 on my machine.<br>
<br>
./configure --enable-threads --enable-float --|enable-sse --prefix=[mypath]|<br>
make<br>
make install <br>
The configure looks ok but no Makefile is generated. When I do make or make install, it gives me the error:<br>
<br>
make: *** No targets specified and no makefile found.  Stop.<br>
<br>
There are couple makefiles in the directory though, Makefile.in and Makefile.am, do I need to rename one of them to Makefile to make it work?<br>
<br>
</blockquote>
<br></div></div>
Per the warning on the Gromacs homepage, version 4.0.6 is a broken distribution.  Use version 4.0.7 instead.<br>
<br>
-Justin<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
Dian<br>
<br>
</blockquote>
<br>
-- <br>
========================================<br>
<br>
Justin A. Lemkul<br>
Ph.D. Candidate<br>
ICTAS Doctoral Scholar<br>
MILES-IGERT Trainee<br>
Department of Biochemistry<br>
Virginia Tech<br>
Blacksburg, VA<br>
jalemkul[at]<a href="http://vt.edu" target="_blank">vt.edu</a> | (540) 231-9080<br>
<a href="http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin" target="_blank">http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin</a><br>
<br>
========================================<br><font color="#888888">
-- <br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br>
</font></blockquote></div><br>