Hi,<br><br>If i remember correctly SPC/E water might be worth trying. There is plenty of research paper in this field. Try this paper<br><br><a href="http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp003020w">http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp003020w</a><br>
<br>Also P,T coupling have effects on Diffusion Coeff.<br><br><br>amit<br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Mar 5, 2010 at 1:29 AM, Sunil Thapa <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:mephysik@yahoo.com">mephysik@yahoo.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0"><tbody><tr><td style="font-family: inherit; font-style: inherit; font-variant: inherit; font-weight: inherit; font-size: inherit; line-height: inherit; font-size-adjust: inherit; font-stretch: inherit;" valign="top">
<div>Respected experts</div>
<div>I want to calculate the self diffusion cofficient of an oxygen molecule in water. The experimental value in the literature is found to be 2.5 x 10-9 nm2/s at 1atm pressure (density 997) and 25. I have considered cut-off Lennard Jones interaction between water and oxygen. I want to reproduce this value. In your experience, which model of water would give the closer value. I have seen that the self diffusion of SPC and TIP4P waters are 3.8 units and 3.2 units whereas the actual value is 2.4 unit. For oxygen the bonding potential has been taken to be harmonic. Any knowledge of related literature would be helpful because I could not find by googling.</div>

<div> </div>
<div>Your idea will really help me.</div>
<div>Neal</div></td></tr></tbody></table><br>

      <br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br></blockquote></div><br>