What is the best way to carry out 2D NPT simulations in gromacs?<div><br></div><div>Currently, I have started with a system of single layer of particles in the xy plane, set pbc=xy and used semiisotropic pressure in the barostat. However, since the box size/volume will change during the course of an NPT simulation, what is the best way to restrict motion in the z-direction? Is using walls a good option? If yes, what is the best way to use them?</div>
<div><br></div><div><br>-- <br>Quaerendo Invenietis-Seek and you shall discover.<br>
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