How do I tell pdb2gmx what the termini are in my molecule. I added a non standard amino acid to the ffoplsaa.rtp database but pdb2gmx says &quot;No N- or C-terminus found: this chain appears to contain no protein&quot;.<div>
<br></div><div>thanks,</div><div><br></div><div>Ilya</div><div> </div>