<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Pressure and volume are very slowly converging thermodynamic variables; it might very well be that your system hasn't converged yet.&nbsp;<div>You should, however, see progression towards some average volume when you plot the volume as a function of time with g_energy.&nbsp;<div><br></div><div>Sander<br><div><br></div><div><br><div><div><div>On Mar 21, 2010, at 16:54 , Wu Rongqin wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite">
<div>
<!-- Converted from text/plain format --><p><font size="2">Dear all,<br>
I performed NVT md to my system and found that T is ok. However, from there I continued to NPT and found that after 100ps, the veraged Pressure is -4.0 bar, far away from 1 bar I set.<br>
Is this because 100ps is not enough for pressure coupling as the starting box is too larger?<br>
How to solve this problem then?<br>
<br>
Regards<br>
<br>
R Q Wu<br>
</font>
</p>

</div>

-- <br>gmx-users mailing list &nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please search the archive at http://www.gromacs.org/search before posting!<br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<br>Can't post? Read http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</blockquote></div><br></div></div></div></div></body></html>