<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Mar 25, 2010 at 9:49 PM, 程迪 <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:chengdi123000@gmail.com">chengdi123000@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
Hi, everyone<br><br>I have two simulations which could run well separately. Now I want to place the box of simulation A onto the box of simulation B. What should I do to realise that? <br clear="all"><br>I&#39;ve tried to copy and paste the .gro and .top file together, but there are several mistakes in grompp. I wonder if there are some better method to merge 2 simulation boxes.<br>
</blockquote><div><br></div><div>copying straight forward will not help, you have to move the atoms of one of the box by the box vectors of the other box. Does this make sense ?</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">

<br>Di Cheng<br><br>University of Science and Technology of China<br>Hefei, Anhui Province 230026<br>P. R. China<br>E-mail: <a href="mailto:chengdi@mail.ustc.edu.cn" target="_blank">chengdi@mail.ustc.edu.cn</a><br>Tel.: +86-15321055911<br>

<br>
<br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br></blockquote></div><br>