Dear gmx-users,<br><br>I have generated 40ns trajectories for DPPC bilayer - water system. The whole 40ns was generated in small trajectories and finally I concatenated all the small trajectories to a big 40 ns trajectory using the following options in trjcat<br>

<br>trjcat   -f   -o   -settime   -tu  <br><br>Now the problem is when I am trying to plot partial density along the bilayer - water interface axis (i.e. Z) using the big trajectory  for different groups (e.g., water,DPPC etc.), density for water comes around 150 kg/m^3. But for any of the small trajectories the value is ok (i.e. around 1000). The plots were done using the folloing tool <br>

<br>   g_density   -f    -o   -n   -s  -d Z <br><br>Can anyone help?                                                                                                 <br clear="all"><br>-- <br>Prithvi Raj Pandey<br><br>