<div>hi there <br clear="all"></div><div>i tried to run MD and i wanted to use *.xtc file in vmd to visualize the protein but unfortunately there is no such file </div><div>i given the command like this</div><div>mdrun -nice 0 -v -s input3.tpr -o md_traj.trr -x md_traj.xtc -c md_final.gro -e md_ener.edr</div>
<div>as procedure this should create md_traj.xtc file rite.....</div><div>so please can u help me out of this mesh.......</div><br>-- <br>Bharath.K.Chakravarthi<br>Ph:9535629260<br>