<P>Hello, I use the 2D periodic boundary&nbsp;along the x and&nbsp;y axises, it has a strange thing. my solvent is dodecane,&nbsp;&nbsp;I&nbsp;view&nbsp;the output&nbsp; trajectory in the VMD,&nbsp;for one molecule, it has some part in </P>
<P>the left(top), and some in the right(bottom), it still connections to each other, how to solve this problem?</P>
<P>&nbsp;</P>
<P>Thank you !</P>