<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div><div>On May 4, 2010, at 10:56 PM, vijaya subramanian wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div class="hmmessage" style="font-size: 10pt; font-family: Verdana; ">Hi Carsten<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><br>A couple of quick questions:<br>I already have gromacs-4.0.7 downloaded from the gromacs website.&nbsp; I found that I couldn't<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><br>use git checkout --track -b release-4-0-patches origin/release-4-0-patches to get the patches.<br>fatal: Not a git repository<br>Do I have to uninstall gromacs-4.0.7 and re-install gromacs obtained from the git site as below,<br>then install gromacs again?<br><br></div></span></blockquote>Hi,</div><div><br></div><div>if the git clone command worked, then the git checkout --track should also work.</div><div>Maybe you forgot to change into the gromacs directory that was produced by the</div><div>first command? You have to do the checkout --track in the directory where a</div><div>.git subdir is present.</div><div><br><blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div class="hmmessage" style="font-size: 10pt; font-family: Verdana; ">git clone<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><a href="git://git.gromacs.org/gromacs.git">git://git.gromacs.org/gromacs.git</a><br></div></span></blockquote>cd gromacs<br><blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div class="hmmessage" style="font-size: 10pt; font-family: Verdana; ">git checkout --track -b release-4-0-patches origin/release-4-0-patches<br></div></span></blockquote></div><div><br></div>Carsten<div><br><div>
<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div><br class="Apple-interchange-newline">--</div><div>Dr.&nbsp;Carsten Kutzner</div><div>Max Planck Institute for Biophysical Chemistry</div><div>Theoretical and Computational Biophysics</div><div>Am Fassberg 11,&nbsp;37077 Goettingen, Germany</div><div>Tel. +49-551-2012313, Fax: +49-551-2012302</div><div><a href="http://www.mpibpc.mpg.de/home/grubmueller/ihp/ckutzne">http://www.mpibpc.mpg.de/home/grubmueller/ihp/ckutzne</a></div><div><br></div></div><br class="Apple-interchange-newline"></span><br class="Apple-interchange-newline"></span>
</div>
<br></div></body></html>