<p>Hi,</p>
<p>Of course you can filter along  one eigenvector. My guess is that the option for 3d projection was also selected (-3d)...<br></p>
<p>Cheers,</p>
<p>Tsjerk<br>
</p>
<p><blockquote type="cite">On May 8, 2010 10:08 AM, &quot;David van der Spoel&quot; &lt;<a href="mailto:spoel@xray.bmc.uu.se">spoel@xray.bmc.uu.se</a>&gt; wrote:<br><br><p><font color="#500050">On 2010-05-08 08.45, Anirban Ghosh wrote:
&gt;
&gt; Hi ALL,
&gt;
&gt; I am trying to do a PCA for my simulation....</font></p>
Please give the entire command line.<br>
You can see projections along 1 PC, don&#39;t know about trj filtering.<p><font color="#500050">


&gt;
&gt; Any suggestion is welcome. Thanks a lot in advance.
&gt;
&gt; Regards,
&gt;
&gt; Anirban



-- 
</font></p><font color="#888888">
David van der Spoel, Ph.D., Professor of Biology<br>
Dept. of Cell &amp; Molec. Biol., Uppsala University.<br>
Box 596, 75124 Uppsala, Sweden. Phone:  +46184714205.<br>
<a href="mailto:spoel@xray.bmc.uu.se" target="_blank">spoel@xray.bmc.uu.se</a>    <a href="http://folding.bmc.uu.se" target="_blank">http://folding.bmc.uu.se</a></font><p><font color="#500050">
-- 
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-u.">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-u.</a>..</font></p></blockquote></p>