Hello,<br><br>Providing information on what type of simulations you&#39;ll be running, what you hope to accomplish with MD, and what analysis tools you expect to use might allow others to better help you :)<br><br>--Venk<br>
<br><div class="gmail_quote">On Mon, May 10, 2010 at 12:57 PM, sonali dhindwal <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:sonali11dhindwal@yahoo.co.in">sonali11dhindwal@yahoo.co.in</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0"><tbody><tr><td style="font-family: inherit; font-style: inherit; font-variant: inherit; font-weight: inherit; font-size: inherit; line-height: inherit; font-size-adjust: inherit; font-stretch: inherit;" valign="top">
Hello All,<br><br>I am new at MD, and i have started doing it few months ago only. I tried to run some simulations but taking all the parameters using some tutorials given online and have not got very good results. <br>Can someone please help in suggesting what is the best way to learn MD using Gromacs in terms of manuals and literature, what should be referred to do a start ?<br>
I am sorry in advance if this query irritates someone, but any kind of help will be highly appreciable.<br>Regards<br><div>--<br>Sonali Dhindwal</div></td></tr></tbody></table><br><br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>__________________________________<br>
Venkatesh Hariharan<br>Columbia University | Biomedical Engineering<br>Graduate Research Assistant<br><br>&quot;You must be the change you wish to see in the world.&quot;<br>--Mohandas Karamchand Gandhi<br><br>