<div>Hi gromacs users</div>
<div> </div>
<div>I want to simulation of pr-dna as follows:</div>
<div> </div>
<div>1) energy minimization 2) equilibration 3) full md.</div>
<div> </div>
<div>Should I use gen_vel=yes in mdp files for both (2) and (3) steps?</div>
<div> </div>
<div>Thank you so much for any help!</div>
<div> </div>
<div> </div>