<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">Hello All<br>This question may sound trivial to many, but as i am new to this field, please help.<br>I want to ask a question regarding my previous query of distortion of protein strucutre after molecular dynamcs simulation.<br>I have noticed that after enegry minimisation using steepest decent algorithm, using emtol of 1000<a name="em"> kJ mol<sup>-1</sup> nm<sup>-1 .</sup></a><br>So is it necessary to do enegry minimisation step before MD, because this is my modeled protein, and i have&nbsp; already done energy minimisation using different program and after that I have done refinement also.<br>Thanks and regards<br><a name="em"><sup><br><br></sup></a><div>--<br>Sonali Dhindwal</div></td></tr></table><br>