Hi everyone,<br><br><br>please I have an important question: <br>When I continue my simulation, I do: tpbconv -s .tpr -extend    -s .tpr <br>                                                            mdrun -v -s .tpr -cpi .cpt -cpo .cpt
-o .trr -c .gro -x .xtc -e .edr -g .log<br><br>At one point of my simulation, I had a problem, the directory that contains all my topology and parameter files  has been deleted.<br><br>So does it affect my simulation? Does gromacs need the topology and parameters at each step or does it stock all of these in the .tpr file?<br>
<br>Thank you<br><br>Carla <br>