<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;"><span style="color: rgb(0, 0, 0);">Hello All,</span><br style="color: rgb(0, 0, 0);"><br style="color: rgb(0, 0, 0);"><span style="color: rgb(0, 0, 0);">I have to do simulation on one of the protein which contains one <span style="font-weight: bold;">dioxy</span> group, as gromacs do not have information to generate toplogy for it, I tried it with PRODRG, but is giving error:</span><br style="color: rgb(0, 0, 0);"><pre style="color: rgb(0, 0, 0);"><font><font size="5">ERRDRG&gt; PRODRG does not deal with mono/di-atomic molecules.<br>PRODRG&gt; Program terminated unsuccessfully, sorry!</font></font></pre>So if there is any server by which I could do the same ? please help<br><br>Thanks and regards.<br style="color: rgb(0, 0, 0);"><br style="color: rgb(0, 0, 0);"><div style="color: rgb(0, 0, 0);">--<br>Sonali Dhindwal</div></td></tr></table><br>