<font face="AdvP6EC0">
<div>Hi gromacs users</div>
<div> </div>
<div>I want to simulate pr-dna by gromacs.I read a article (Biophysical Journal 87(6) 3799–3813) inwhich helical parameters for DNA (rise, slide, twist, roll, tilt, shift) calculated by md simulation, but I did not understand two things:</div>

<div> </div>
<div>How and what command these parameters were calculated?</div>
<div> </div>
<div>I read gromacs manual. in that there is only  <font face="NimbusRomNo9L-Medi">g helix  <font face="NimbusRomNo9L-Medi">and  g helixorient  for <font face="NimbusRomNo9L-Medi">Protein specific analysis.</font></font><font face="NimbusRomNo9L-Regu"></font></font></div>

<div> </div>
<div>can any body help me how to do this ?</div>
<div> </div>
<div> </div></font>