Hi Everyone,<br><br>please I have a question concerning g_rmsf.<br>I need to compare the RMSF from my initial structure to the RMSF of my average structure.<br><br>To do so, I need to calculate the average per residue.<br>
<br>When I did <br><br>g_rmsf -s .tpr -f .xtc -n .ndx -b xx -e yy -o rmsf<br><br>or <br><br>g_rmsf -s .tpr -f .xtc -n .ndx -b xx -e yy  -res -o rmsf <br><br>I got the same result, when choosing C-alpha for root mean square calculation.<br>
<br>So please can anyone explain how can I get the average per residue over a period of time?<br><br>Thanks,<br>Carla<br>