<br><br>----- Original Message -----<br>From: "Justin A. Lemkul" &lt;jalemkul@vt.edu&gt;<br>Date: Friday, June 18, 2010 23:55<br>Subject: Re: [gmx-users] Plotting Energies versus time<br>To: Discussion list for GROMACS users &lt;gmx-users@gromacs.org&gt;<br><br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; Rabab Toubar wrote:<br>&gt; &gt;Hi,<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt;I want to extract the values for potential E, kinetic E, total <br>&gt; E, and temperature from the log file so as to plot them versus <br>&gt; time. In NAMD it is easy to do that using cat |grep, is there a <br>&gt; similar way to do it in GMX<br>&gt; &gt;<br>&gt; <br>&gt; That's what g_energy is for.<br><br>Indeed. Perhaps Rabab would learn quite a few things about how GROMACS workflows work by looking through some tutorial material. This lesson must be in at least one of them. :-)<br><br>Mark