I redid the entire thing after that first mail in which i reported the error related to fftw(including running the make uninstall commands and removing the folders entirely and getting fresh ones). I apologize for not specifying this and like I said... there seemed to be no errors this time except when I ran make install for gromacs. The error looks like this:<div>
<div><div class="h5"><div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px; "> </font>make[3]: *** [install-man1] Error 1</div><div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px; ">&gt; </font>make[3]: Leaving directory `/fs/home/sm868/gromacs/man/man1&#39;</div>
<div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px; ">&gt; </font>make[2]: *** [install-am] Error 2</div><div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px; ">&gt; </font>make[2]: Leaving directory `/fs/home/sm868/gromacs/man/man1&#39;</div>
<div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px; ">&gt; </font>make[1]: *** [install-recursive] Error 1</div><div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px; ">&gt; </font>make[1]: Leaving directory `/fs/home/sm868/gromacs/man&#39;</div>
</div></div><div><div><div></div><div class="h5"><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px; ">&gt; </font>make: *** [install-recursive] Error 1<br></div></div>
</div></div><div class="h5">I didn&#39;t find any other error.. is there a way to look for them other than looking at what is being printed while the command is running? I tried $ grep &quot;Error&quot; */* in the folder but found nothing more than entries in different scripts etc.</div>
<div class="h5"><br></div><div class="h5"><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br><br><div class="gmail_quote">On Sun, Jun 20, 2010 at 1:27 AM, Mark Abraham <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:mark.abraham@anu.edu.au">mark.abraham@anu.edu.au</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;"><div class="im"><br><br>----- Original Message -----<br>From: Sai Pooja &lt;<a href="mailto:saipooja@gmail.com" target="_blank">saipooja@gmail.com</a>&gt;<br>
</div><div class="im">Date: Sunday, June 20, 2010 15:09<br>Subject: Re: [gmx-users] Installing gromacs from git<br>To: Discussion list for GROMACS users &lt;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a>&gt;<br>
<br></div><div><div></div><div class="h5"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>History log:<div><br></div><div><div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>189  ./configure --enable-threads --enable-float --prefix=/fs/home/sm868/fftw-3.2.2</div>
<div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>  190  make</div><div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>  191  clear</div>
<div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>  192  make install</div><div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>  193  cd ..</div>
 <div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>  194  cd gromacs</div><div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>  195  ls</div>
<div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>  196  export CPPFLAGS=&quot;-I/fs/home/sm868/fftw-3.2.2/include&quot;</div><div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>  197  export LDFLAGS=&quot;-L/fs/home/sm868/fftw-3.2.2/lib&quot;</div>
<div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>  198  ./bootstrap</div> <div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>  199  ls</div>
<div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>  200  ./configure --prefix=/fs/home/sm868/gromacs</div><div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>  201  make</div>
<div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>  202  make install</div></div><div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br>
</div><div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>Everything works till I get the following error with make install(after it runs for a while) :</div>
 </div></div><div><div><div></div><div class="h5"><div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>make[3]: *** [install-man1] Error 1</div><div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>make[3]: Leaving directory `/fs/home/sm868/gromacs/man/man1&#39;</div>
<div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>make[2]: *** [install-am] Error 2</div><div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>make[2]: Leaving directory `/fs/home/sm868/gromacs/man/man1&#39;</div>
 <div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>make[1]: *** [install-recursive] Error 1</div><div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>make[1]: Leaving directory `/fs/home/sm868/gromacs/man&#39;</div>
</div></div><div><div><div></div><div class="h5"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>make: *** [install-recursive] Error 1<br><br></div></div>This is just make cleaning up after recursive invocation. The actual error is further up. Note that if configure failed according to your previous email, then there&#39;s no point to using make.<br>
<font color="#888888"><br>Mark<br></font></div></div><div><div></div><div class="h5"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"></font><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><br>
&gt; </font>On Sat, Jun 19, 2010 at 7:49 PM, Mark Abraham <span dir="ltr">&lt;<a>mark.abraham@anu.edu.au</a>&gt;</span> wrote:<br> <div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204, 204, 204);padding-left:1ex">
<div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>----- Original Message -----<br><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>From: Sai Pooja &lt;<a>saipooja@gmail.com</a>&gt;<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> Date: Sunday, June 20, 2010 9:35<br><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>Subject: Re: [gmx-users] Installing gromacs from git<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>To: Discussion list for GROMACS users &lt;<a>gmx-users@gromacs.org</a>&gt;<br> <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br>
</div><div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font>I am sorry that was a typo in the mail. It was set to lib <br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br></div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>That makes it hard for us to have confidence in the rest of your command lines - copying and pasting the results of &quot;history&quot; is a good way to avoid such problems.<br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>As such I can only suggest looking for &quot;error&quot; in the last 100 lines of config.log and seeing what you find. That, and trying it all again :-)<br>
<font color="#888888"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>Mark</font><div>
<div></div><div> <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br>
<div class="gmail_quote"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font>On Sat, Jun 19, 2010 at 7:28 PM, Justin A. Lemkul <span dir="ltr">&lt;<a>jalemkul@vt.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>
  <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204, 204, 204);padding-left:1ex"><div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font><br>
  <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font><br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> Sai Pooja wrote:<br>
  <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204, 204, 204);padding-left:1ex"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> Hi,<br>
  <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font><br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> I followed the following steps to install gromacs from the git repository:<br>
  <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font><br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> 1) installed git<br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> 2) got a clone of gromacs using the anonymous option<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> 3) installed fftw libraries using<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> ./configure --enable-float --prefix=/fs/home/sm868<br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> make<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> make install<br>
  <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font><br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> 4)export CPPFLAGS=-I/fs/home/sm868/include<br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font>    export LDFLAGS=-L/fs/home/sm868/include<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> 6)ran ./bootstrap<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> 7)ran ./configure --prefix=/fs/home/sm868<br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> 8)I get the error - checking for sqrt in -lm... yes<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> checking for fftw3.h... yes<br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> checking for main in -lfftw3f... no<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> configure: error: Cannot find fftw3f library<br>
  <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font><br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> </blockquote> <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br>
 </div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> You set your LDFLAGS to the /include subdirectory; you want to set it to the /lib subdirectory.<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> -Justin<div>
<br><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br>
  <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204, 204, 204);padding-left:1ex"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> Can someone help me with this?<br>
  <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font><br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> Pooja<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> -- <br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> Quaerendo Invenietis-Seek and you shall discover.<br>
  <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font><br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> </blockquote> <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br>
 </div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> -- <br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> ========================================<br>
  <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font><br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> Justin A. Lemkul<br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> Ph.D. Candidate<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> ICTAS Doctoral Scholar<br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> MILES-IGERT Trainee<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> Department of Biochemistry<br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> Virginia Tech<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> Blacksburg, VA<br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> jalemkul[at]<a href="http://vt.edu" target="_blank">vt.edu</a> | (540) 231-9080<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> <a href="http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin" target="_blank"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin</a><br>
  <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font><br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> ========================================<br>
 <font color="#888888"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> -- <br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> gmx-users mailing list    <a>gmx-users@gromacs.org</a><br>
  <a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font>http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a>gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font> Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br>
  </font></blockquote></div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font><br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font><br clear="all">
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font><br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font>-- <br>
 <font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; </font>Quaerendo Invenietis-Seek and you shall discover.<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> &gt; -- <br><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; gmx-users mailing list    <a>gmx-users@gromacs.org</a><br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> &gt; <a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> <br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> &gt; before posting!<br><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>&gt; www interface or send it to <a>gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> &gt; Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a> </div>
</div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>--<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> gmx-users mailing list    <a>gmx-users@gromacs.org</a><br> <a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank"><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> www interface or send it to <a>gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font> Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br>
</blockquote></div><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br clear="all">
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font><br><font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>-- <br>
<font style="font-style:normal;font-weight:normal;background-color:rgb(245, 248, 240);font-size:14px">&gt; </font>Quaerendo Invenietis-Seek and you shall discover.<br>  </div> &gt; -- <br>&gt; gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
&gt; <a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>&gt; Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> <br>
&gt; before posting!<br>&gt; Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>&gt; www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
&gt; Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a>
</div></div><br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Quaerendo Invenietis-Seek and you shall discover.<br>

</div>