Dear GMX-users,<br><br>This is Justin. <br>I am performing 
coarse-grained simulation on a protein-lipid bilayer system. This is a 
MARTINI CG model.<br>I have successfully completed a 360ns simulation, 
during which the time step is 30 fs.<br>
<br>I would like to extend the simulation to 1micro-second. The commands
 I used are:<br><br>$tpbconv_mpi_d -s md_360ns.tpr -extend 360000 -o 
md_720ns.tpr<br><br>$mdrun_mpi_d -s md_720ns.tpr  -append -e 
md_360ns.edr -o md_360ns.trr -g md_360ns.log -cpi state.cpt<br>
<br>However, I received the following message:<br><br>Checkpoint file is
 from part 1, new output files will be suffixed part0002.<br>Getting 
Loaded...<br>Reading file md_720ns.tpr, VERSION 4.0.3 (double precision)<br><br>
Reading checkpoint file state.cpt generated: Mon Jun 14 09:48:10 2010<br><br>Loaded
 with Money<br><br>starting mdrun &#39;Protein in POPE bilayer&#39;<br>24000000 
steps, 720000.0 ps (continuing from step 12000000, 360000.0 ps).<br>
step 12000000, remaining runtime:     0 s          <br>p0_6991:  
p4_error: interrupt SIGSEGV: 11<br><br>I have searched the mail-list, 
but found no similar report. I also search through google, but no answer
 seems satisfactory.<br>
<br>I once performed extending simulation for all atom simulation, and 
the method mentioned above worked.<br><br>Is anyone familiar with 
MARTINI CG simulation?<br>Could you give me some suggestions?<br><br>Many
 thanks!<br>
<br>Justin<br>