Hi!<br>The protein I am attempting to simulate has a CL atom. When I run pdb2gmx I get the following error message. Any help in overcoming this problem would be appreciated. <br>Thanks<br>James  <br>------------------------------------------------------<br>
Program pdb2gmx, VERSION 4.0<br>Source code file: pdb2gmx.c, line: 429<br><br>Fatal error:<br>Atom CL- in residue CL- 574 not found in rtp entry with 1 atoms<br>             while sorting atoms<br>-------------------------------------------------------<br>
<br clear="all"><br>-- <br>Jayasundar Jayant James<br><br><a href="http://www.chick.com/reading/tracts/0096/0096_01.asp">www.chick.com/reading/tracts/0096/0096_01.asp</a>) <br><br>