
<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div><div>On Jun 28, 2010, at 2:34 PM, Syed Tarique Moin wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" style="position: static; z-index: auto; "><tbody><tr><td valign="top" style="font: inherit;">hello,<br><br>I am running a simulation on dual core processor using the following command<br><br>mpirun -np 8 mdrun_mpi -s top<br><br>The

job is running but it is not distributed on other node, i mean i cant

see the process on other nodes as well. I see only on node01 but it has

only 4 processors. Can anybody suggest me! <font style="font-style: italic; color: rgb(255, 0, 0); font-weight: bold;" size="4"><span style="font-family: times new roman,new york,times,serif;"></span></font><font style="font-style: italic; color: rgb(255, 0, 0); font-weight: bold;" size="4"><span style="font-family: times new roman,new york,times,serif;"><br><br><br></span></font></td></tr></tbody></table><br></blockquote></div><div><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0; "><span class="Apple-style-span" style="font-size: medium;">Hi,</span></span></div><div><br class="webkit-block-placeholder"></div><div>find out how you generally run a simple parallel job with the MPI framework</div><div>that you are using. If that works, Gromacs should also run in parallel.</div><div>You are going to have to provide some kind of machine / host / nodefile.</div><div><br></div><div>Carsten</div>

<br></body></html>