<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hi Justin,<div><br></div><div>what kind of error message do you get if you run this system</div><div>on a single core without MPI?</div><div><br></div><div>Carsten</div><div><br></div><div><br><div><div>On Jul 8, 2010, at 9:36 PM, 张春雷 wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite">Dear all,<br><br>I have post this question about a two weeks ago. During these days, I followed suggestions from Mark and weixin, but did not fix it. Here, I repeat it again to seek more help.<br><br>I attempt to extend MD simulation for a coarse-grained system. CG models are in MARTINI form. Simulation was carried out on Gromacs 4.02, 4.03 or 4.07.<br>
<br>I tried to use check point file state.cpt to extend my simulation. The mdrun program can read to the check file. But it reported error like this: <br><br>Reading checkpoint file state.cpt generated: Mon Jun 14 09:48:10 2010<br>
<br>Loaded
 with Money<br><br>starting mdrun 'Protein in POPE bilayer'<br>24000000 
steps, 720000.0 ps (continuing from step 12000000, 360000.0 ps).<br>
step 12000000, remaining runtime:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0 s&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>p0_6991:&nbsp; 
p4_error: interrupt SIGSEGV: 11<br><br>I check the <b>state.cpt</b> file using <b>gmxdump</b> and compare it with other checkpoint files that can be used for extending All-atom simulations. I found that in the CG check point file, some sections are missing: <b>box-v (3x3)</b> and <b>thermostat-integral</b>.<br>
I am not sure whether this missing sections cause my run crash. If it is, could any one tell me possible reasons that result in the loss of box-v and thermostat-integral and how to fix the problem?<br><br>Your suggestions are greatly helpful and appreciated.<br>
<br>Justin Zhang<br>&nbsp;<br><br><br><div class="gmail_quote">在 2010年6月25日 下午4:45,张春雷 <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:chunleizhang.pku@gmail.com">chunleizhang.pku@gmail.com</a>&gt;</span>写道:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
Information shown by gmxcheck:<br><br><b>Checking file state.cpt</b><br><br># Atoms&nbsp; 9817<br>Last frame&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; -1 time 360000.000&nbsp;&nbsp; <br><br><br>Item&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; #frames Timestep (ps)<br>Step&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<br>Time&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<br>

Lambda&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<br>Coords&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<br>Velocities&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<br>Forces&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>Box&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<br><br><b>Checking file state_prev.cpt</b><br><br># Atoms&nbsp; 9817<br>Last frame&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; -1 time 359010.000&nbsp;&nbsp; <br><br>

<br>Item&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; #frames Timestep (ps)<br>Step&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<br>Time&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<br>Lambda&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<br>Coords&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<br>Velocities&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<br>Forces&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>Box&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<br><br><b>Checking file md_360ns.trr</b><br>

trn version: GMX_trn_file (double precision)<br>Reading frame&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0 time&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.000&nbsp;&nbsp; <br># Atoms&nbsp; 9817<br>Reading frame&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2000 time 300000.000&nbsp;&nbsp; <br><br><br>Item&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; #frames Timestep (ps)<br>Step&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2401&nbsp;&nbsp;&nbsp; 150<br>

Time&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2401&nbsp;&nbsp;&nbsp; 150<br>Lambda&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2401&nbsp;&nbsp;&nbsp; 150<br>Coords&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2401&nbsp;&nbsp;&nbsp; 150<br>Velocities&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2401&nbsp;&nbsp;&nbsp; 150<br>Forces&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>Box&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2401&nbsp;&nbsp;&nbsp; 150<br><br>Is anything wrong? <br><br><br><div class="gmail_quote">

2010/6/25 Mark Abraham <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:mark.abraham@anu.edu.au" target="_blank">mark.abraham@anu.edu.au</a>&gt;</span><div><div></div><div class="h5"><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">

<div><br><br>----- Original Message -----<br>From: 张春雷 &lt;<a href="mailto:chunleizhang.pku@gmail.com" target="_blank">chunleizhang.pku@gmail.com</a>&gt;<br>Date: Friday, June 25, 2010 16:46<br>Subject: Re: [gmx-users] P4_error for extending coarse grained MD simulations<br>

To: Discussion list for GROMACS users &lt;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a>&gt;<br><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>The last .gro file only provides coordinates of the system. No velocity is recorded. Actually, what I attempt to achieve is a binary identical trajectory. So I think the velocity from the last step is critical.<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>I have tried another approach in which the checkpoint file is neglected.<br>

 <font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>$mdrun_mpi_d -s md_720ns.tpr&nbsp; -e md_720ns.edr -o md_720ns.trr -g  md_720ns.log<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>It works. So the checkpoint file appears to contain some error. But it is generated by a normally finished production simulation.<br>

<br></div>What does gmxcheck say about all the files involved?<br><font color="#888888"><br>Mark</font><div><div></div><div><br><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Have&nbsp; you encountered similar things?<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Thank you for your suggestions!<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font> &nbsp;<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><div class="gmail_quote"><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>在 2010年6月25日 上午9:16,weixin <span dir="ltr">&lt;<a>xwxnju@gmail.com</a>&gt;</span>写道:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;"> <div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>&nbsp;</div>

 <div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>How about using the last .gro file to continue your simulation?</div> <div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>&nbsp;</div>

 <div class="gmail_quote"><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>2010/6/24 张春雷 <span dir="ltr">&lt;<a>chunleizhang.pku@gmail.com</a>&gt;</span><br>

 <blockquote class="gmail_quote" style="padding-left: 1ex; margin: 0px 0px 0px 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204);"><div><div></div><div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Dear GMX-users,<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>This is Justin. <br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>I am performing coarse-grained simulation on a protein-lipid bilayer system. This is a MARTINI CG model.<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>  I have successfully completed a 360ns simulation, during which the time step is 30 fs.<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>I would like to extend the simulation to 1micro-second. The commands I used are:<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>$tpbconv_mpi_d -s md_360ns.tpr -extend 360000 -o md_720ns.tpr<br>  <font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>$mdrun_mpi_d -s md_720ns.tpr&nbsp; -append -e md_360ns.edr -o md_360ns.trr -g md_360ns.log -cpi state.cpt<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>However, I received the following message:<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Checkpoint file is from part 1, new output files will be suffixed part0002.<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>  Getting Loaded...<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Reading file md_720ns.tpr, VERSION 4.0.3 (double precision)<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Reading checkpoint file state.cpt generated: Mon Jun 14 09:48:10 2010<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Loaded with Money<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>starting mdrun 'Protein in POPE bilayer'<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>  24000000 steps, 720000.0 ps (continuing from step 12000000, 360000.0 ps).<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>step 12000000, remaining runtime:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0 s&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>p0_6991:&nbsp; p4_error: interrupt SIGSEGV: 11<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>I have searched the mail-list, but found no similar report. I also search through google, but no answer seems satisfactory.<br>

  <font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>I once performed extending simulation for all atom simulation, and the method mentioned above worked.<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Is anyone familiar with MARTINI CG simulation?<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Could you give me some suggestions?<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Many thanks!<br>  <font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Justin<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br>

</div></div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>--<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a>gmx-users@gromacs.org</a><br>

<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank"><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>  Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>www interface or send it to <a>gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>  Can't post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br>

</blockquote></div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br> <font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>--<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font> gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a>gmx-users@gromacs.org</a><br>

 <a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank"><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font> Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font> Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font> www interface or send it to <a>gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>

<font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font> Can't post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br>

</blockquote></div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br></div></div> &gt; -- <br><div><div></div><div>&gt; gmx-users mailing list&nbsp;&nbsp;&nbsp; <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>

&gt; <a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>&gt; Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> <br>

&gt; before posting!<br>&gt; Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>&gt; www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>

&gt; Can't post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a>
</div></div><br>--<br>
gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can't post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br></blockquote></div></div></div><br>
</blockquote></div><br>
-- <br>gmx-users mailing list &nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please search the archive at http://www.gromacs.org/search before posting!<br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<br>Can't post? Read http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</blockquote></div><br><div>
<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div><br class="Apple-interchange-newline">--</div><div>Dr.&nbsp;Carsten Kutzner</div><div>Max Planck Institute for Biophysical Chemistry</div><div>Theoretical and Computational Biophysics</div><div>Am Fassberg 11,&nbsp;37077 Goettingen, Germany</div><div>Tel. +49-551-2012313, Fax: +49-551-2012302</div><div><a href="http://www.mpibpc.mpg.de/home/grubmueller/ihp/ckutzne">http://www.mpibpc.mpg.de/home/grubmueller/ihp/ckutzne</a></div><div><br></div></div><br class="Apple-interchange-newline"></span><br class="Apple-interchange-newline"></span>
</div>
<br></div></body></html>