Hi ALL,<br><br>I have a system consisting of protein+lipid+ligand+water which has been simulated for 10 ns. Now I want to make a compressed trajectory from the original one by keeping only the protein and the ligand. I am trying to do so by using trjconv with an index file. But every time trjconv is showing the default options and I am not able to select the protein and the ligand simultaneously to generate the output. How can I do this? Any suggestion is welcome.<br>
Thanks a lot in advance. <br><br><br>Regards,<br><br>Anirban<br>