<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">Dear all<br><br>According to the manual, pdb2gmx generates all the angles, pairs and dihedrals automatically in a polymer chain. Because I need nothing of them do you know any fast way to avoid this generation?<br><br>The only think I found in the manual is to add [ exclusions ] in the .rtp file for whatever I don't want to be generated, but I am wondering if there is any better way.<br><br>Thanks in advance<br>Chrysostomos<br></td></tr></table><br>