<span class="Apple-style-span" style="font-family: arial, sans-serif; font-size: 13px; border-collapse: collapse; ">Hello everyone,<div><br></div><div>in the NPT simulation I run I have 2 layers of water and palmitic acid in between.</div>
<div>How i should make my index file to see the different kinds of hydrogen bonds?</div><div><br></div><div>ps</div><div>there will be water - water , O= ..... O= between PLM, O= ...... OH between PLM and water and OH .... OH between water and PLM hydrogen bonds</div>
<div><br></div><div><br></div><div>thanks in advance</div><div><br></div><div>Regards,</div><div><br></div><div>Vasilis</div></span>