
<html>

<head>

<style><!--

.hmmessage P

{

margin:0px;

padding:0px

}

body.hmmessage

{

font-size: 10pt;

font-family:微软雅黑

}

--></style>

</head>

<body class='hmmessage'>

Dear gmx users,<BR>

&nbsp; I am performing a MD simulation of a polymer film using GROMACS-4.0.7. My computer has a four-core CPU, which enables the parallel implementation. At first, I used mpimdrun to simulate the system, only to find with -v that the vol is too small (about 0.2) and the imb F is too big (over 150%) so about 4 days is required for finishing 4ns MD. However, when I turn to non-parallel mdrun, only half of the time (about 2 days) is required for finishing the same task. Is it reasonable? How to explain it?<BR>

&nbsp; Thanks a lot for any replies to this post<BR>

&nbsp;<BR>

&nbsp; Chaofu Wu, Dr.<BR>                                               </body>

</html>