I'm glad there's some interest in the test set. I'm happy to update what I did for 4.0.7 for 4.5 also, but there are a number of issues that need attention from someone other than me. I listed those that occurred to me here http://lists.gromacs.org/pipermail/gmx-developers/2009-August/003586.html, linked also from the Test Set page on the website.<br><br>Among those issues is that we need a single GROMACS version that produces reliable reference data for all cases we wish to test! Various of the 3.3.x series have known issues that make test set maintenance awkward.<br><br>If I do the necessary updates to release-3-3-patches branch to make a hypothetical GROMACS 3.3.4 that is useful for making test set reference calculations, should we make such a release? Alternatively, we can just announce that the reference data was generated by the 3-3-version with a given git hash and not release. Thoughts?<br><br>Mark<br><br>----- Original Message -----<br>From: Rossen Apostolov &lt;rossen.apostolov@cbr.su.se&gt;<br>Date: Wednesday, August 4, 2010 17:56<br>Subject: Re: [gmx-users] tests for gmx 4.5<br>To: gmx-users@gromacs.org<br><br> <span><p>        <meta content="text/html; charset=UTF-8" http-equiv="Content-Type">   <table><tbody><tr><td text="#000000" bgcolor="#ffffff"><p><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>     Hi,<br>     <font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>     The tests haven't been ported to 4.5 yet but I hope to fix that     before the final release.<br>     <font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>     Rossen<br>     <font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>     On 7/31/10 7:08 PM, Alan wrote:     </p><blockquote cite="mid:AANLkTinoJzx6o=Esfhq4M=sAwtL880SZ6r+GkpanCZgc@mail.gmail.com" type="cite">Is there a proper set of tests for gmx 4.5 because       neither <a moz-do-not-send="true" href="ftp://ftp.gromacs.org/pub/tests/gmxtest-4.0.4.tgz" target="1">ftp://ftp.gromacs.org/pub/tests/gmxtest-4.0.4.tgz</a>       or "git clone git://<a moz-do-not-send="true" href="http://git.gromacs.org/regressiontests.git" target="1">git.gromacs.org/regressiontests.git</a>"       is working due to the several modifications done in gmx 4.5       including automatic thread for mdrun (I am using a Mac with dual       core) and more warnings.       <div>         <br>       </div>       <div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Thanks,</div>       <div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br>       </div>       <div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Alan<br clear="all">         <font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>         -- <br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>         Alan Wilter S. da Silva, D.Sc. - CCPN Research Associate<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>         Department of Biochemistry, University of Cambridge. <br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>         80 Tennis Court Road, Cambridge CB2 1GA, UK.<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>         &gt;&gt;<a moz-do-not-send="true" href="http://www.bio.cam.ac.uk/%7Eawd28" target="1">http://www.bio.cam.ac.uk/~awd28</a>&lt;&lt;<br>       </div>     </blockquote>     <font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br>   </td></tr></tbody></table> </p></span> &gt; -- <br>&gt; gmx-users mailing list&nbsp;&nbsp;&nbsp; gmx-users@gromacs.org<br>&gt; http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<br>&gt; Please search the archive at http://www.gromacs.org/search <br>&gt; before posting!<br>&gt; Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>&gt; www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<br>&gt; Can't post? Read http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php