<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;"><div id="yiv1635197709"><table id="yiv1635197709bodyDrftID" class="yiv1635197709" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0"><tbody><tr><td id="yiv1635197709drftMsgContent" style="font-family: inherit; font-style: inherit; font-variant: inherit; font-weight: inherit; font-size: inherit; line-height: inherit; font-size-adjust: inherit; font-stretch: inherit;">Hello All,<br><br>I have a query regarding the restarts of the jobs after crash.<br>I want to simulate a protein for 2 ns but in between due to system shutdown, it stopped, and I made a restart using this command:<br><pre>mdrun -s topol.tpr -cpi state.cpt -append</pre>now I checked the rmsd of in between by producing a .xtc file of the job which ran till now and then checked g_rms of the simulation, it is showing a graph like this,(I have attached in the mail)<br><br>this is showing rmsd after the point the
 job was restarted with some error in the beginning.<br>I want to know if there will be error at the end of the job too in the output file, .gro ?<br>Thanks in advance<br>Regards<br><br><div>--<br>Sonali Dhindwal</div></td></tr></tbody></table></div></td></tr></table><br>